婴儿的阴茎发黑，有多个原因，常见原因有不注意卫生，也可能是先天性因素和激素因素所导致。

1、不注意卫生：不注意阴茎卫生，导致局部灰尘附着，显得发黑，这种情况每天清洗将阴茎洗净即可。

2、先天性原因：比如遗传性的原因，也会导致阴茎体发黑，父亲出现阴茎体黑时，小孩子阴茎体也会发黑。

3、激素因素：由于在怀孕期间患儿母亲的激素分泌，导致阴茎体发黑。但在患儿出生后会随着生长，这种情况往往会慢慢恢复到正常，不需要治疗。

所以小孩子阴茎发黑，还是要具体原因具体分析，不能盲目采取措施，搞清楚是什么原因，才能有效处理。